Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AlkP97793 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AlkP97793 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
AlkP97793 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AlkP97793 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AlkP97793 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AlkP97793 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AlkP97793 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AlkP97793 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AlkP97793 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AlkP97793 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AlkP97793 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AlkP97793 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AlkP97793 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AlkP97793 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AlkP97793 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AlkP97793 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AlkP97793 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AlkP97793 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AlkP97793 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AlkP97793 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AlkP97793 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AlkP97793 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AlkP97793 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AlkP97793 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AlkP97793 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AlkP97793 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AlkP97793 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AlkP97793 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AlkP97793 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AlkP97793 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AlkP97793 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AlkP97793 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AlkP97793 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AlkP97793 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AlkP97793 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AlkP97793 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AlkP97793 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AlkP97793 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AlkP97793 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AlkP97793 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AlkP97793 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
AlkP97793 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
AlkP97793 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AlkP97793 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AlkP97793 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AlkP97793 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AlkP97793 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AlkP97793 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AlkP97793 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AlkP97793 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AlkP97793 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AlkP97793 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
AlkP97793 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AlkP97793 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AlkP97793 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AlkP97793 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AlkP97793 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AlkP97793 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AlkP97793 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
AlkP97793 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AlkP97793 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AlkP97793 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AlkP97793 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AlkP97793 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AlkP97793 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AlkP97793 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AlkP97793 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AlkP97793 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AlkP97793 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AlkP97793 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
AlkP97793 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AlkP97793 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
AlkP97793 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
AlkP97793 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
AlkP97793 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AlkP97793 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AlkP97793 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AlkP97793 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AlkP97793 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AlkP97793 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AlkP97793 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AlkP97793 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AlkP97793 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AlkP97793 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AlkP97793 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AlkP97793 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AlkP97793 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
AlkP97793 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AlkP97793 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AlkP97793 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AlkP97793 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AlkP97793 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AlkP97793 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AlkP97793 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AlkP97793 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AlkP97793 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AlkP97793 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
AlkP97793 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
AlkP97793 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms