Protein–RNA interactions for Protein: P97770

Thumpd3, THUMP domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd3P97770 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Thumpd3P97770 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms