Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smarcc1P97496 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smarcc1P97496 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smarcc1P97496 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smarcc1P97496 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smarcc1P97496 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smarcc1P97496 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smarcc1P97496 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smarcc1P97496 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smarcc1P97496 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smarcc1P97496 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smarcc1P97496 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smarcc1P97496 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms