Protein–RNA interactions for Protein: P97489

Gata5, Transcription factor GATA-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata5P97489 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gata5P97489 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gata5P97489 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gata5P97489 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gata5P97489 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gata5P97489 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gata5P97489 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gata5P97489 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gata5P97489 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gata5P97489 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gata5P97489 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gata5P97489 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gata5P97489 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gata5P97489 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gata5P97489 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gata5P97489 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gata5P97489 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gata5P97489 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gata5P97489 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gata5P97489 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gata5P97489 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gata5P97489 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gata5P97489 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gata5P97489 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gata5P97489 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gata5P97489 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gata5P97489 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gata5P97489 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gata5P97489 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gata5P97489 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gata5P97489 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gata5P97489 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gata5P97489 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gata5P97489 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gata5P97489 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gata5P97489 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gata5P97489 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gata5P97489 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gata5P97489 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gata5P97489 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gata5P97489 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gata5P97489 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gata5P97489 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gata5P97489 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gata5P97489 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gata5P97489 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gata5P97489 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gata5P97489 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gata5P97489 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gata5P97489 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gata5P97489 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gata5P97489 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gata5P97489 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gata5P97489 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gata5P97489 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gata5P97489 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gata5P97489 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gata5P97489 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gata5P97489 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gata5P97489 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gata5P97489 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gata5P97489 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gata5P97489 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gata5P97489 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gata5P97489 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gata5P97489 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gata5P97489 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gata5P97489 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gata5P97489 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gata5P97489 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gata5P97489 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gata5P97489 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gata5P97489 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gata5P97489 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gata5P97489 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gata5P97489 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gata5P97489 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gata5P97489 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gata5P97489 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gata5P97489 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gata5P97489 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gata5P97489 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gata5P97489 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gata5P97489 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gata5P97489 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gata5P97489 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gata5P97489 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gata5P97489 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gata5P97489 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gata5P97489 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gata5P97489 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gata5P97489 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gata5P97489 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gata5P97489 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gata5P97489 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gata5P97489 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gata5P97489 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gata5P97489 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gata5P97489 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gata5P97489 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms