Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lig3P97386 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lig3P97386 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lig3P97386 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lig3P97386 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lig3P97386 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lig3P97386 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lig3P97386 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lig3P97386 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lig3P97386 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lig3P97386 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lig3P97386 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lig3P97386 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lig3P97386 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lig3P97386 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lig3P97386 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lig3P97386 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lig3P97386 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lig3P97386 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lig3P97386 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lig3P97386 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lig3P97386 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lig3P97386 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lig3P97386 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lig3P97386 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lig3P97386 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lig3P97386 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lig3P97386 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lig3P97386 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lig3P97386 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lig3P97386 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lig3P97386 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lig3P97386 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lig3P97386 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lig3P97386 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lig3P97386 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lig3P97386 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lig3P97386 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lig3P97386 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lig3P97386 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lig3P97386 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lig3P97386 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lig3P97386 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lig3P97386 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lig3P97386 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lig3P97386 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lig3P97386 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lig3P97386 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lig3P97386 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lig3P97386 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lig3P97386 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lig3P97386 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lig3P97386 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lig3P97386 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lig3P97386 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lig3P97386 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lig3P97386 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lig3P97386 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lig3P97386 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lig3P97386 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lig3P97386 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lig3P97386 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lig3P97386 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lig3P97386 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lig3P97386 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lig3P97386 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lig3P97386 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lig3P97386 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lig3P97386 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lig3P97386 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lig3P97386 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lig3P97386 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lig3P97386 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms