Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3f3aP84244 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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