Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms