Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ldb1P70662 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ldb1P70662 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms