Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msx3P70354 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Msx3P70354 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msx3P70354 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msx3P70354 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msx3P70354 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msx3P70354 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Msx3P70354 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Msx3P70354 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msx3P70354 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msx3P70354 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms