Protein–RNA interactions for Protein: P70321

Hoxb13, Homeobox protein Hox-B13, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb13P70321 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb13P70321 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms