Protein–RNA interactions for Protein: P70314

Pitx1, Pituitary homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx1P70314 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitx1P70314 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitx1P70314 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitx1P70314 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitx1P70314 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitx1P70314 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitx1P70314 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitx1P70314 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitx1P70314 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitx1P70314 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitx1P70314 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitx1P70314 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitx1P70314 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitx1P70314 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitx1P70314 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitx1P70314 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitx1P70314 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitx1P70314 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitx1P70314 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitx1P70314 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitx1P70314 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitx1P70314 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitx1P70314 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitx1P70314 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitx1P70314 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitx1P70314 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitx1P70314 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitx1P70314 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitx1P70314 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitx1P70314 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitx1P70314 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitx1P70314 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitx1P70314 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitx1P70314 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitx1P70314 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitx1P70314 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitx1P70314 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitx1P70314 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitx1P70314 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitx1P70314 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitx1P70314 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitx1P70314 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitx1P70314 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitx1P70314 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitx1P70314 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitx1P70314 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitx1P70314 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitx1P70314 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitx1P70314 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitx1P70314 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitx1P70314 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitx1P70314 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitx1P70314 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pitx1P70314 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms