Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp7P70280 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp7P70280 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms