Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Surf6P70279 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf6P70279 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Surf6P70279 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Surf6P70279 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms