Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad54lP70270 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms