Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chl1P70232 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chl1P70232 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chl1P70232 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chl1P70232 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Chl1P70232 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chl1P70232 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chl1P70232 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms