Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Traf5P70191 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Traf5P70191 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Traf5P70191 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Traf5P70191 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Traf5P70191 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Traf5P70191 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Traf5P70191 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf5P70191 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms