Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabrb3P63080 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrb3P63080 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms