Protein–RNA interactions for Protein: P63006

Lhx1, LIM/homeobox protein Lhx1, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx1P63006 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Lhx1P63006 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lhx1P63006 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lhx1P63006 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lhx1P63006 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Lhx1P63006 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lhx1P63006 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lhx1P63006 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lhx1P63006 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lhx1P63006 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lhx1P63006 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lhx1P63006 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lhx1P63006 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lhx1P63006 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lhx1P63006 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lhx1P63006 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lhx1P63006 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lhx1P63006 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lhx1P63006 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lhx1P63006 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lhx1P63006 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lhx1P63006 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lhx1P63006 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Lhx1P63006 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lhx1P63006 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lhx1P63006 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Lhx1P63006 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Lhx1P63006 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lhx1P63006 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lhx1P63006 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lhx1P63006 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lhx1P63006 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lhx1P63006 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lhx1P63006 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lhx1P63006 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lhx1P63006 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lhx1P63006 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lhx1P63006 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lhx1P63006 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lhx1P63006 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lhx1P63006 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lhx1P63006 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Lhx1P63006 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lhx1P63006 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Lhx1P63006 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lhx1P63006 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lhx1P63006 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lhx1P63006 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Lhx1P63006 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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Lhx1P63006 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Lhx1P63006 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lhx1P63006 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lhx1P63006 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Lhx1P63006 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Lhx1P63006 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Lhx1P63006 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lhx1P63006 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Lhx1P63006 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lhx1P63006 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lhx1P63006 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lhx1P63006 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Lhx1P63006 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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Lhx1P63006 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Lhx1P63006 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lhx1P63006 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lhx1P63006 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lhx1P63006 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lhx1P63006 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lhx1P63006 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lhx1P63006 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lhx1P63006 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lhx1P63006 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lhx1P63006 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lhx1P63006 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lhx1P63006 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lhx1P63006 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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