Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab3cP62823 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab3cP62823 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab3cP62823 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab3cP62823 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab3cP62823 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab3cP62823 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab3cP62823 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab3cP62823 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms