Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms