Protein–RNA interactions for Protein: P61807

Snn, Stannin, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnnP61807 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SnnP61807 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SnnP61807 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SnnP61807 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SnnP61807 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SnnP61807 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SnnP61807 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SnnP61807 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SnnP61807 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SnnP61807 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SnnP61807 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SnnP61807 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SnnP61807 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SnnP61807 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SnnP61807 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SnnP61807 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SnnP61807 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SnnP61807 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SnnP61807 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SnnP61807 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SnnP61807 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SnnP61807 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SnnP61807 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SnnP61807 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SnnP61807 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SnnP61807 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SnnP61807 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SnnP61807 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SnnP61807 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SnnP61807 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SnnP61807 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SnnP61807 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SnnP61807 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SnnP61807 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SnnP61807 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SnnP61807 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SnnP61807 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SnnP61807 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SnnP61807 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SnnP61807 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SnnP61807 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SnnP61807 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SnnP61807 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SnnP61807 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SnnP61807 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SnnP61807 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SnnP61807 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SnnP61807 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SnnP61807 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SnnP61807 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SnnP61807 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SnnP61807 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SnnP61807 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SnnP61807 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnnP61807 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnnP61807 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnnP61807 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnnP61807 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnnP61807 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnnP61807 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnnP61807 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnnP61807 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnnP61807 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnnP61807 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnnP61807 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SnnP61807 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnnP61807 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnnP61807 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnnP61807 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnnP61807 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnnP61807 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnnP61807 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnnP61807 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnnP61807 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnnP61807 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnnP61807 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnnP61807 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnnP61807 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SnnP61807 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnnP61807 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SnnP61807 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnnP61807 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnnP61807 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnnP61807 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnnP61807 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnnP61807 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnnP61807 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnnP61807 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnnP61807 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnnP61807 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnnP61807 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SnnP61807 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnnP61807 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnnP61807 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SnnP61807 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnnP61807 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SnnP61807 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnnP61807 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnnP61807 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnnP61807 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms