Protein–RNA interactions for Protein: P61407

Tdrd6, Tudor domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 2,134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd6P61407 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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Tdrd6P61407 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Tdrd6P61407 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms