Protein–RNA interactions for Protein: P60229

Eif3e, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3eP60229 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eif3eP60229 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms