Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms