Protein–RNA interactions for Protein: P59054

Csrnp1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp1P59054 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csrnp1P59054 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csrnp1P59054 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csrnp1P59054 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csrnp1P59054 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csrnp1P59054 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csrnp1P59054 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csrnp1P59054 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csrnp1P59054 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csrnp1P59054 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csrnp1P59054 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Csrnp1P59054 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Csrnp1P59054 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csrnp1P59054 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Csrnp1P59054 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csrnp1P59054 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Csrnp1P59054 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csrnp1P59054 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csrnp1P59054 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csrnp1P59054 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csrnp1P59054 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csrnp1P59054 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Csrnp1P59054 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csrnp1P59054 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csrnp1P59054 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csrnp1P59054 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csrnp1P59054 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csrnp1P59054 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csrnp1P59054 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csrnp1P59054 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csrnp1P59054 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csrnp1P59054 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csrnp1P59054 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csrnp1P59054 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csrnp1P59054 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csrnp1P59054 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csrnp1P59054 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csrnp1P59054 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csrnp1P59054 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csrnp1P59054 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csrnp1P59054 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csrnp1P59054 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csrnp1P59054 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csrnp1P59054 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csrnp1P59054 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csrnp1P59054 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csrnp1P59054 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms