Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
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Ctdsp1P58466 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ctdsp1P58466 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ctdsp1P58466 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ctdsp1P58466 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ctdsp1P58466 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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