Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms