Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gsc2P56916 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gsc2P56916 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms