Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms