Protein–RNA interactions for Protein: P56716

Rp1, Oxygen-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,095 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1P56716 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rp1P56716 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rp1P56716 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rp1P56716 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rp1P56716 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rp1P56716 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rp1P56716 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rp1P56716 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rp1P56716 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms