Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lim2P56563 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lim2P56563 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lim2P56563 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lim2P56563 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lim2P56563 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lim2P56563 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lim2P56563 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lim2P56563 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lim2P56563 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms