Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp5bP56480 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp5bP56480 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp5bP56480 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp5bP56480 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp5bP56480 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp5bP56480 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp5bP56480 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5bP56480 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5bP56480 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5bP56480 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5bP56480 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5bP56480 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5bP56480 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5bP56480 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5bP56480 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5bP56480 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5bP56480 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5bP56480 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5bP56480 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5bP56480 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5bP56480 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5bP56480 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5bP56480 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5bP56480 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5bP56480 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5bP56480 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5bP56480 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5bP56480 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5bP56480 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5bP56480 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5bP56480 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5bP56480 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5bP56480 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5bP56480 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5bP56480 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5bP56480 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5bP56480 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5bP56480 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5bP56480 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5bP56480 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5bP56480 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5bP56480 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5bP56480 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5bP56480 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5bP56480 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5bP56480 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5bP56480 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5bP56480 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5bP56480 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5bP56480 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5bP56480 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5bP56480 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5bP56480 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5bP56480 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5bP56480 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5bP56480 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5bP56480 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5bP56480 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5bP56480 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5bP56480 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5bP56480 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp5bP56480 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp5bP56480 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp5bP56480 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp5bP56480 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp5bP56480 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp5bP56480 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp5bP56480 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp5bP56480 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp5bP56480 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp5bP56480 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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