Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtskP55097 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtskP55097 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtskP55097 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtskP55097 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtskP55097 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtskP55097 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtskP55097 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtskP55097 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtskP55097 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtskP55097 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CtskP55097 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtskP55097 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtskP55097 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtskP55097 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtskP55097 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CtskP55097 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtskP55097 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CtskP55097 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtskP55097 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CtskP55097 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CtskP55097 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CtskP55097 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CtskP55097 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CtskP55097 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CtskP55097 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CtskP55097 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtskP55097 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
CtskP55097 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtskP55097 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtskP55097 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CtskP55097 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtskP55097 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtskP55097 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtskP55097 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtskP55097 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtskP55097 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtskP55097 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtskP55097 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtskP55097 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CtskP55097 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CtskP55097 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtskP55097 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtskP55097 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtskP55097 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtskP55097 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtskP55097 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CtskP55097 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CtskP55097 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtskP55097 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtskP55097 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CtskP55097 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtskP55097 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtskP55097 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtskP55097 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CtskP55097 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtskP55097 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CtskP55097 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtskP55097 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtskP55097 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtskP55097 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtskP55097 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtskP55097 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtskP55097 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtskP55097 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtskP55097 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CtskP55097 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtskP55097 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtskP55097 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CtskP55097 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtskP55097 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtskP55097 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtskP55097 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CtskP55097 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtskP55097 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtskP55097 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtskP55097 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CtskP55097 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtskP55097 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtskP55097 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtskP55097 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtskP55097 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtskP55097 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CtskP55097 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CtskP55097 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CtskP55097 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CtskP55097 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CtskP55097 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtskP55097 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtskP55097 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtskP55097 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtskP55097 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CtskP55097 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CtskP55097 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CtskP55097 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CtskP55097 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CtskP55097 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CtskP55097 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CtskP55097 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CtskP55097 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms