Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GemP55041 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GemP55041 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GemP55041 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GemP55041 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GemP55041 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GemP55041 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GemP55041 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GemP55041 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GemP55041 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GemP55041 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GemP55041 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GemP55041 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GemP55041 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GemP55041 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GemP55041 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GemP55041 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GemP55041 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GemP55041 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GemP55041 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GemP55041 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GemP55041 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GemP55041 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GemP55041 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GemP55041 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GemP55041 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GemP55041 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GemP55041 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GemP55041 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GemP55041 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GemP55041 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GemP55041 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GemP55041 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GemP55041 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GemP55041 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GemP55041 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GemP55041 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GemP55041 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GemP55041 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GemP55041 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GemP55041 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GemP55041 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GemP55041 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GemP55041 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GemP55041 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GemP55041 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GemP55041 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GemP55041 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GemP55041 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GemP55041 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GemP55041 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GemP55041 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GemP55041 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GemP55041 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GemP55041 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GemP55041 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GemP55041 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GemP55041 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GemP55041 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GemP55041 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GemP55041 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GemP55041 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GemP55041 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GemP55041 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GemP55041 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GemP55041 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GemP55041 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GemP55041 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GemP55041 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GemP55041 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GemP55041 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GemP55041 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GemP55041 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GemP55041 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GemP55041 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GemP55041 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GemP55041 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GemP55041 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GemP55041 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GemP55041 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GemP55041 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GemP55041 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GemP55041 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GemP55041 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GemP55041 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GemP55041 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GemP55041 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GemP55041 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GemP55041 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GemP55041 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GemP55041 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GemP55041 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GemP55041 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GemP55041 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GemP55041 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GemP55041 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GemP55041 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GemP55041 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GemP55041 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GemP55041 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms