Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms