Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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