Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms