Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa6P50704 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa6P50704 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa6P50704 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa6P50704 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa6P50704 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa6P50704 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa6P50704 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms