Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms