Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms