Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psen1P49769 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psen1P49769 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Psen1P49769 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Psen1P49769 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psen1P49769 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psen1P49769 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psen1P49769 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psen1P49769 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psen1P49769 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Psen1P49769 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Psen1P49769 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms