Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CitP49025 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CitP49025 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CitP49025 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CitP49025 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CitP49025 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CitP49025 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CitP49025 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CitP49025 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CitP49025 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CitP49025 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CitP49025 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CitP49025 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CitP49025 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CitP49025 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CitP49025 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CitP49025 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CitP49025 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CitP49025 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CitP49025 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CitP49025 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CitP49025 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CitP49025 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CitP49025 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CitP49025 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CitP49025 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CitP49025 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CitP49025 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CitP49025 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CitP49025 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CitP49025 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CitP49025 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CitP49025 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CitP49025 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CitP49025 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CitP49025 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CitP49025 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CitP49025 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CitP49025 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CitP49025 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CitP49025 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CitP49025 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CitP49025 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CitP49025 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CitP49025 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CitP49025 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CitP49025 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CitP49025 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CitP49025 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CitP49025 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CitP49025 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CitP49025 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CitP49025 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CitP49025 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CitP49025 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CitP49025 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CitP49025 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CitP49025 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CitP49025 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CitP49025 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CitP49025 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CitP49025 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CitP49025 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CitP49025 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CitP49025 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CitP49025 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CitP49025 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CitP49025 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CitP49025 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CitP49025 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CitP49025 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CitP49025 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CitP49025 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CitP49025 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CitP49025 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CitP49025 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CitP49025 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CitP49025 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CitP49025 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CitP49025 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CitP49025 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CitP49025 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CitP49025 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CitP49025 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CitP49025 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CitP49025 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CitP49025 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CitP49025 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CitP49025 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CitP49025 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CitP49025 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CitP49025 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CitP49025 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CitP49025 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CitP49025 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CitP49025 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CitP49025 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CitP49025 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CitP49025 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CitP49025 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms