Protein–RNA interactions for Protein: P48540

Gdnf, Glial cell line-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GdnfP48540 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
GdnfP48540 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GdnfP48540 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GdnfP48540 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GdnfP48540 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GdnfP48540 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GdnfP48540 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GdnfP48540 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GdnfP48540 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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