Protein–RNA interactions for Protein: P47708

Rph3a, Rabphilin-3A, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3aP47708 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rph3aP47708 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rph3aP47708 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rph3aP47708 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rph3aP47708 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rph3aP47708 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rph3aP47708 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rph3aP47708 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rph3aP47708 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rph3aP47708 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rph3aP47708 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rph3aP47708 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rph3aP47708 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rph3aP47708 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rph3aP47708 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rph3aP47708 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rph3aP47708 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rph3aP47708 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rph3aP47708 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rph3aP47708 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rph3aP47708 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rph3aP47708 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rph3aP47708 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rph3aP47708 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rph3aP47708 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rph3aP47708 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rph3aP47708 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rph3aP47708 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rph3aP47708 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rph3aP47708 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rph3aP47708 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rph3aP47708 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rph3aP47708 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rph3aP47708 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rph3aP47708 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rph3aP47708 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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