Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pax9P47242 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pax9P47242 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pax9P47242 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax9P47242 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax9P47242 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax9P47242 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms