Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf1P46099 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf1P46099 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klf1P46099 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf1P46099 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf1P46099 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf1P46099 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf1P46099 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf1P46099 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms