Protein–RNA interactions for Protein: P46062

Sipa1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sipa1P46062 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sipa1P46062 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms