Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms