Protein–RNA interactions for Protein: P42337

Pik3ca, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3caP42337 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pik3caP42337 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pik3caP42337 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pik3caP42337 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pik3caP42337 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pik3caP42337 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pik3caP42337 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pik3caP42337 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pik3caP42337 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pik3caP42337 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pik3caP42337 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pik3caP42337 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pik3caP42337 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pik3caP42337 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pik3caP42337 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pik3caP42337 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pik3caP42337 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pik3caP42337 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pik3caP42337 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms