Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TfamP40630 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TfamP40630 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TfamP40630 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TfamP40630 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TfamP40630 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TfamP40630 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TfamP40630 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TfamP40630 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TfamP40630 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TfamP40630 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TfamP40630 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TfamP40630 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TfamP40630 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TfamP40630 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TfamP40630 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TfamP40630 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TfamP40630 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TfamP40630 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TfamP40630 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TfamP40630 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TfamP40630 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TfamP40630 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TfamP40630 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TfamP40630 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TfamP40630 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TfamP40630 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TfamP40630 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TfamP40630 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TfamP40630 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TfamP40630 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TfamP40630 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TfamP40630 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TfamP40630 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TfamP40630 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TfamP40630 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TfamP40630 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TfamP40630 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TfamP40630 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TfamP40630 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TfamP40630 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TfamP40630 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TfamP40630 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TfamP40630 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TfamP40630 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TfamP40630 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TfamP40630 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TfamP40630 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TfamP40630 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TfamP40630 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TfamP40630 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TfamP40630 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TfamP40630 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TfamP40630 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TfamP40630 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TfamP40630 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TfamP40630 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TfamP40630 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TfamP40630 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TfamP40630 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TfamP40630 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TfamP40630 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TfamP40630 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TfamP40630 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TfamP40630 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TfamP40630 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TfamP40630 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TfamP40630 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TfamP40630 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TfamP40630 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TfamP40630 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TfamP40630 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TfamP40630 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TfamP40630 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TfamP40630 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TfamP40630 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TfamP40630 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TfamP40630 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TfamP40630 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TfamP40630 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TfamP40630 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TfamP40630 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TfamP40630 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TfamP40630 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TfamP40630 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TfamP40630 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TfamP40630 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TfamP40630 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TfamP40630 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TfamP40630 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TfamP40630 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TfamP40630 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TfamP40630 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TfamP40630 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TfamP40630 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TfamP40630 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TfamP40630 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TfamP40630 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TfamP40630 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TfamP40630 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms